《秘密帝王研究所》是一部充满了想象力和欢乐的动画片，它讲述了一个关于蜡笔的有趣故事。在蜡笔盒里，各种颜色的蜡笔都有自己的个性和特点。红色蜡笔热情奔放，蓝色蜡笔沉稳冷静，绿色蜡笔活泼可爱，黄色蜡笔开朗乐观。它们每天都在一起玩耍和冒险，共同经历着各种各样的趣事。
一天，蜡笔盒被一个淘气的小男孩打开了，小男孩把蜡笔们都拿出来，开始在墙上乱涂乱画。蜡笔们很生气，它们决定要给小男孩一个教训。于是，它们联合起来，用自己的颜色在墙上画了一个大大的怪物，怪物张着血盆大口，吓得小男孩屁滚尿流地逃跑了。
蜡笔们终于出了一口气，它们又开心地玩耍起来。但是，小男孩并没有就此罢休，他回来后带来了他的小伙伴，他们一起把蜡笔盒打翻了，蜡笔们散落了一地。蜡笔们很伤心，它们不知道该怎么办。就在这时，一个好心的小女孩发现了它们，她把蜡笔们一一捡起来，放回蜡笔盒里。蜡笔们很感激小女孩，它们决定要好好报答她。
