《神秘研究院帝王爱学习》是一部讲述女主角赵婉秋误入军统，与军统特工冷清寒相爱相杀的故事。赵婉秋本是一名普通的医护人员，因一次意外而被军统特务绑架，从此被卷入了军统的纷争。在军统内部，赵婉秋凭借自己的智慧和勇气，逐渐获得了军统特务们的信任，并与冷清寒结下梁子。
冷清寒是一个冷酷无情的军统特工，对赵婉秋一开始充满戒备。但随着时间的推移，他逐渐被赵婉秋的善良和坚强所吸引。两人在执行任务的过程中，逐渐产生了感情。然而，他们的感情却遭到了军统的反对。军统高层认为赵婉秋是一个威胁，并命令冷清寒除掉她。冷清寒为了保护赵婉秋，与军统高层决裂。
赵婉秋和冷清寒一起逃离了军统，开始了新的生活。然而，军统并没有放过他们，派出了大批特务追杀他们。赵婉秋和冷清寒在逃亡的过程中，经历了重重磨难。但他们始终没有放弃，最终战胜了军统的追杀，过上了幸福的生活。
